梨CRK家族基因及其腐烂病菌侵染响应成员的鉴定

• 作者: 刘河 孙娥 左存武 朵虎 赵丹 马富鹏 马春玲
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 梨 CRK 基因家族 腐烂病 生物信息分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 963-973
• 页数: 11页
• 分类号: S661.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0759

摘要

在植物响应逆境过程中,半胱氨酸富集类受体激酶(Cysteine-rich receptor like kinase,CRK)起重要的调控作用.本研究中以结构域Stress-antifung (Pfam:PF01657)和Pkinase (Pfam:PF00069)的保守序列为种子序列,在全基因组范围鉴定了梨(Pryus spp.)CRK家族成员.此外,对其蛋白理化性质、进化特征、基因在染色体上的位置、顺式作用元件(cis-acting regulatory element,cis-element)和表达模式进行了分析.共获得32个CRK家族成员,其氨基酸数、分子量和等电点分别介于440～1 217、48.90～137.02kD和5.31～8.59,主要位于质膜.根据进化分析,将来自梨、拟南芥、苹果、番茄和水稻的156个CRK分为6个亚组,梨CRK主要分布于亚组Ⅳ,V和Ⅵ.梨CRK中存在5个串联重复的基因簇,共包含了20个成员.此外,该基因家族所有成员的启动子区域都存在多个响应激素和逆境信号的cis-element.接种腐烂病菌Valsa pyri(Vp)后,杜梨(Pyrus betulifolia,抗病)和‘早酥’梨(Pyrus bretschneideri,感病)中分别发现8个和10个CRK发生了差异表达,6个基因在两种资源中都发生了差异表达.差异基因中,Pbr001477.1和Pbr000205.4在抗、感病资源中都显著上调,而其他基因的表达量在两种资源中呈现不同的变化趋势.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘河	甘肃农业大学园艺学院	4	0	0.0	0.0
2	朵虎	甘肃农业大学园艺学院	3	0	0.0	0.0
3	赵丹	甘肃农业大学园艺学院	2	0	0.0	0.0
4	孙娥	甘肃农业大学园艺学院	1	0	0.0	0.0
5	马富鹏	甘肃农业大学园艺学院	1	0	0.0	0.0
6	马春玲	甘肃农业大学园艺学院	1	0	0.0	0.0
7	左存武	甘肃农业大学园艺学院	19	31	3.0	5.0