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岩原鲤遗传多样性和种群历史动态研究
岩原鲤遗传多样性和种群历史动态研究
作者:
姚富城
张富铁
张晓宇
王剑伟
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
岩原鲤
Cytb基因
遗传多样性
种群历史动态
赤水
万州
摘要:
研究基于线粒体DNA细胞色素b(mtDNA Cyt b)基因序列,对2013—2017年间采自我国长江上游贵州省赤水市和重庆市万州区共161尾岩原鲤(Procypris rabaudi)个体进行了遗传多样性分析.结果表明,在所有个体序列中,A、T、C、G碱基的平均含量分别为30.2%、27.9%、28.2%和13.7%,(A+T)含量(58.1%)明显大于(G+C)含量(41.9%),表现出较强的反G偏倚性.161条序列检测到18个变异位点,定义了15种单倍型,整体单倍型多样性指数(Hd)、核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.590、0.00132;岩原鲤赤水群体遗传多样性水平低于万州群体;万州群体的单倍型多样性和核苷酸多样性均呈现逐年降低的趋势,但是赤水群体的单倍型多样性和核苷酸多样性呈现逐年增加的趋势.基于最大似然法构建的系统发育树和单倍型网络图结果一致,万州和赤水群体并未形成明显的地理分布格局.Mega 6.0软件计算2个群体之间的遗传距离为0.001.Fst值统计表明,2个地理群体间Fst值为0.01749(P>0.05),群体间没有出现遗传分化现象.两群体间基因交流频繁,基因流Nm=24.71.分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)显示:98.25%的遗传变异是由群体内产生的.中性检验结果表明万州岩原鲤群体历史上曾发生过种群扩张事件,时间约为0.15百万年前.岩原鲤群体整体上遗传多样性偏低,急需提出合理的管理措施,以加强长江流域岩原鲤物种的资源保护.
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篇名
岩原鲤遗传多样性和种群历史动态研究
来源期刊
水生生物学报
学科
农学
关键词
岩原鲤
Cytb基因
遗传多样性
种群历史动态
赤水
万州
年,卷(期)
2020,(2)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
330-338
页数
9页
分类号
S932.4
字数
7750字
语种
中文
DOI
10.7541/2020.040
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王剑伟
中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室
61
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19.0
32.0
5
张晓宇
中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室
25
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6.0
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张富铁
中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室
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姚富城
中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室
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岩原鲤
Cytb基因
遗传多样性
种群历史动态
赤水
万州
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研究来源
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研究去脉
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期刊影响力
水生生物学报
主办单位:
中国科学院水生生物研究所
中国海洋湖沼学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-3207
CN:
42-1230/Q
开本:
大16开
出版地:
湖北省武汉市武昌珞珈山水生所 (武昌东湖南路7号)
邮发代号:
82-329
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
3348
总下载数(次)
8
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