广西局地西番莲病毒病的病原鉴定及优势病毒分析

• 作者: 刘丽辉 崔丽贤 李战彪 林珊宇 秦碧霞 蔡健和 谢慧婷 陈锦清
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 西番莲 小RNA测序 黄瓜花叶病毒 夜来香花叶病毒 东亚西番莲病毒
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 病原学
• 页码范围: 387-393
• 页数: 7页
• 分类号: S432.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.000435

摘要

在广西采集表现斑驳、花叶症状疑似病毒病的西番莲叶片样品,利用小RNA测序技术,结合生物信息学分析,鉴定侵染西番莲的病毒种类.参考测序结果采用DAS-ELISA和RT-PCR方法对2015～2018年间采集的385份疑似病毒病样品进行检测,分析引发广西西番莲病毒病的优势病毒种类.结果 显示:小RNA共获得20 921 061 clean reads,拼接获得560个contigs,其中99个contigs被注释为夜来香花叶病毒(telosma mosaic virus,TeMV),97个contigs被注释为黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV),69个contigs被注释为东亚西番莲病毒(East Asian passiflora virus,EAPV),12个contigs被注释为大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV).提取送测序的同批样品叶片的总RNA进行RT-PCR验证,可检测出TeMV、EAPV和CMV 3种病毒,未检出SMV.采用DAS-ELISA和RT-PCR对采集的样品进行检测,结果发现284份样品为阳性样品,检出率为73.76％,其中TeMV的检出率最高为64.16％,其次为EAPV和CMV,检出率分别为41.30％和11.43％;3种病毒存在复合侵染现象,其中TeMV +EAPV的检出率最高为24.94％,TeMV+CMV的检出率为4.16％,EAPV+CMV的检出率为0.26％,3种病毒复合侵染的检出率为4.94％.