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华侨大学学报(自然科学版)期刊
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采用偏最小二乘法的基因-药物共模块识别
采用偏最小二乘法的基因-药物共模块识别
作者:
李玉双
毛玉杰
魏东
原文服务方:
华侨大学学报(自然科学版)
偏最小二乘算法
药物关联网络
基因模块
药物模块
基因-药物共模块
摘要:
首先,将药物二维化学结构转化为数值序列,计算药物之间的皮尔逊相关系数,进而构建药物关联网络;然后,在带有基因网络约束的稀疏偏最小二乘算法的基础上,加入药物关联网络信息,提出伴有基因和药物关联网络正则约束的稀疏偏最小二乘(SGDPLS)算法;最后,将SGDPLS算法应用于基因-药物共模块识别.结果表明:药物关联网络信息的加入能够有效提高所识别的共模块中基因模块与药物模块的相关性,增加共模块的生物可解释性.
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偏最小二乘法回归
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文献信息
篇名
采用偏最小二乘法的基因-药物共模块识别
来源期刊
华侨大学学报(自然科学版)
学科
关键词
偏最小二乘算法
药物关联网络
基因模块
药物模块
基因-药物共模块
年,卷(期)
2020,(1)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
121-125
页数
5页
分类号
Q332
字数
语种
中文
DOI
10.11830/ISSN.1000-5013.201903012
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
李玉双
燕山大学理学院
8
1
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2
毛玉杰
燕山大学理学院
1
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0.0
3
魏东
燕山大学理学院
4
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1.0
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版权信息
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引文网络
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节点文献
偏最小二乘算法
药物关联网络
基因模块
药物模块
基因-药物共模块
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
华侨大学学报(自然科学版)
主办单位:
华侨大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-5013
CN:
35-1079/N
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1980-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
2681
总下载数(次)
0
总被引数(次)
14643
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