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七星瓢虫触角转录组及嗅觉相关基因分析
七星瓢虫触角转录组及嗅觉相关基因分析
作者:
唐启河
张棋麟
张蔓
杨雪娇
林连兵
江宇航
陈均远
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
七星瓢虫
触角转录组
食性分化
基因注释
嗅觉相关基因
摘要:
[目的]瓢虫科食性高度分化.本研究旨在通过建立七星瓢虫Coccinella septempunctata触角转录组数据库,探讨其触角嗅觉相关基因与食性分化的关系.[方法]采用Illumina HiSeq 4000高通量测序平台对七星瓢虫成虫触角转录组进行测序、组装、注释,挖掘嗅觉相关基因,并与已发表的茄二十八星瓢虫Henosepilachna viginyioctopunctata转录组进行比较.[结果]共获得七星瓢虫触角转录组31 775条unigenes,其中69.71%的序列得以注释,NR数据库中注释最多,为20 539条.据注释信息,挖掘到27个嗅觉相关基因,包括1个气味结合蛋白(odorant binding protein,OBP)基因,13个化学感受蛋白(chemosensory protein,CSP)基因,4个气味受体(odorant receptor,OR)基因,7个味觉受体(gustatory receptor,GR)基因和2个感觉神经元膜蛋白(sensory neuron membrane protein,SNMP)基因.相对应地,在植食性茄二十八星瓢虫转录组中鉴定到38个嗅觉相关基因,包括七星瓢虫中未发现的1个离子型受体(ionotropic receptor,IR)基因.在各类型嗅觉相关基因中,茄二十八星瓢虫转录组的OBP基因比例(13.16%)高于七星瓢虫触角转录组的(3.70%),而七星瓢虫触角转录组的GR基因比例(25.93%)则高于茄二十八星瓢虫转录组的(13.16%).[结论]触角嗅觉相关基因数目不是昆虫食性分化的主因.本研究获得了七星瓢虫触角转录组学资源,初步探讨了嗅觉相关基因同瓢虫食性分化的关系,为了解瓢虫乃至昆虫食性分化的分子基础提供了信息.
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文献信息
篇名
七星瓢虫触角转录组及嗅觉相关基因分析
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
七星瓢虫
触角转录组
食性分化
基因注释
嗅觉相关基因
年,卷(期)
2020,(6)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
717-726
页数
10页
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
10.16380/j.kcxb.2020.06.007
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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触角转录组
食性分化
基因注释
嗅觉相关基因
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研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
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