杏CCD1和CCD4启动子克隆及顺式作用元件分析

• 作者: 冯靖 卢娟芳 席万鹏 杨灿
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杏 CCD1 CCD4 启动子 功能分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 939-952
• 页数: 14页
• 分类号: S662.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0610

摘要

以‘轮台小白杏’杏果实为材料,根据转录组数据库中的CCD1和CCD4基因片段,通过基因组步移法克隆了两个启动子pPaCCD1和PaCCD4,获得了长度分别为2 233和1 838 bp的启动子序列.利用PlantCare数据库对启动子序列的顺式作用元件进行预测分析,结果表明两个启动子均含有多个光响应、脱落酸和茉莉酸甲酯等共有顺式作用元件,此外,PaCCD1启动子中含有刺激诱导和种子特异性调控等响应元件,PaCCD4启动子中含有赤霉素、低温和增强转录水平等响应元件,这暗示PaCCD1和PaCCD4的表达可能受光信号、激素和胁迫等多种信号的共同调节.为进一步确定其启动子核心区,基于基因结构特征与顺式作用元件的分布情况,分别构建两个不同长度缺失启动子与GUS基因融合的表达载体并瞬时转化烟草叶片.GUS活性检测发现,在PaCCD1的启动子上游-2 174～-1 700 bp、-1 700～-1 200bp、-1 200～-600 bp区间内均包含影响启动子活性的顺式作用元件;PaCCD4启动子在上游-1 740～-1 200 bp和-1 200～-600 bp这两个区间内含有顺式作用元件,随着启动子片段的缺失,PaCCD1和PaCCD4的GUS活性逐渐减弱.PaCCD1的启动子核心区域在-1 200～2 174bp区段内,PaCCD4的启动子核心区域在-1 200～1 740 bp区段内.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	席万鹏	西南大学园艺园林学院	18	223	8.0	14.0
5	杨灿	西南大学园艺园林学院	7	1	1.0	1.0
6	卢娟芳	西南大学园艺园林学院	5	27	3.0	5.0
7	冯靖	西南大学园艺园林学院	2	0	0.0	0.0