辣椒MYB基因家族的鉴定及与辣味关系分析

• 作者: 居利香 成善汉 汪志伟 舒黄英 赵成志 雷欣
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 MYB转录因子 转录组测序 辣椒素含量
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 875-892
• 页数: 18页
• 分类号: S641.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0735

摘要

利用生物信息学方法从辣椒全基因组数据库中筛选出172个MYB转录因子,并对其序列特征、染色体定位、进化关系、蛋白质保守基序和基因结构等进行综合分析,同时通过辣椒果实不同发育阶段胎座组织转录组测序筛选与辣味可能相关的MYB基因.结果 表明,辣椒MYB有1R、2R(R2R3)、3R、6R等类型,其中R2R3型居多,结构域分析表明其具有典型的W型R2R3保守基序;获取20个motif元件并进行位置分析,发现同一支MYB蛋白具有相似的结构特征;进一步与拟南芥聚类得到37个类群,推测具有多种生物学功能.转录组测序发现,CaMYB98、CaMYB168等12个MYB表达量符合‘黄魔王’辣椒果实胎座组织在不同发育期的辣椒素含量变化规律,推测其可能通过特异位点的结合来上调或下调相关蛋白的表达,从而达到对辣椒素代谢路径的调控,可作为辣味调控的重要候选基因进一步研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	成善汉	海南大学园艺学院	35	114	7.0	9.0
2	汪志伟	海南大学园艺学院	8	5	2.0	2.0
3	居利香	海南大学园艺学院	4	2	1.0	1.0
4	雷欣	海南大学园艺学院	4	2	1.0	1.0
5	赵成志	海南大学园艺学院	2	0	0.0	0.0
6	舒黄英	海南大学园艺学院	2	0	0.0	0.0