滇龙胆8-羟香叶醇氧化还原酶基因的克隆与表达分析

• 作者: 张晓东 李彩霞 李湫 王伟妍 鄢秋紫
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 滇龙胆 8-羟香叶醇氧化还原酶 克隆 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 生理与育种
• 页码范围: 200-209
• 页数: 10页
• 分类号: Q786
• 字数: 6719字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201901012

摘要

滇龙胆主要药效成分为龙胆苦苷,而8-羟香叶醇氧化还原酶基因Gr8HGO是龙胆苦苷生物合成途径的结构基因.为了研究Gr8HGO基因的功能,该文克隆了滇龙胆Gr8HGO基因,并进行表达分析.结果表明:(1)共克隆到 5 个 Gr8HGO 基因,其 GenBank 登录号分别为 KP722029.1(Gr8HGO-1)、KP722030.1(Gr8HGO-2)、KP722031.1(Gr8HGO-3)、KP722032.1(Gr8HGO-4)、KP723852.1(Gr8HGO-5).(2)Gr8HGO-1基因全长1 062 bp,编码353个氨基酸,其他4个基因全长1 131 bp,编码376个氨基酸;理化性质分析结果表明5个蛋白单体相对分子质量约40 kD,理论等电点在5.47～5.95之间,均为疏水稳定蛋白.(3)信号序列分析结果表明5个蛋白均不含信号肽、跨膜螺旋和叶绿体转运肽;亚细胞定位分析结果表明5个蛋白可能定位于细胞质;结构域预测结果表明除Gr8HGO-1蛋白仅包含乙醇脱氢酶N端结构域(IPR013154)和C端结构域(IPR013149)外,其他4个蛋白还包含聚酮合酶、烯酰还原酶结构域(IPR020843).(4)系统发育分析结果表明这些Gr8HGO蛋白与长春花Cr8HGO蛋白亲缘关系最近.(5)qPCR结果表明Gr8HGO基因主要在叶中表达,在根和茎中表达量很低.该研究为后续龙胆苦苷生物合成途径的解析奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张晓东	玉溪师范学院化学生物与环境学院	31	71	5.0	7.0
2	李彩霞	玉溪师范学院化学生物与环境学院	19	43	4.0	6.0
3	王伟妍	玉溪师范学院化学生物与环境学院	1	0	0.0	0.0
4	李湫	玉溪师范学院化学生物与环境学院	1	0	0.0	0.0
5	鄢秋紫	玉溪师范学院化学生物与环境学院	1	0	0.0	0.0