龙须菜四分孢子体发育过程的WGCNA分析

• 作者: 刘娟 姜敏杰 张敬宇 李晓东 毕桂萁 王津果 胡依依 隋正红
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 龙须菜 四分孢子体 加权基因共表达网络分析 发育
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 61-75
• 页数: 15页
• 分类号: Q75
• 字数: 9825字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20190044

摘要

龙须菜是一种重要的产琼胶海藻,对其繁殖发育的研究将有助于了解龙须菜的生长,有助于育种.本研究对龙须菜不同育性品系(981和鲁龙1号)在不同发育阶段的表达谱数据,采用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法构建基因共表达网络,共获得32个模块.其中,模块最大基因数量为2 577个,最小基因数为66个.经过筛选发现与品系相关的模块(以0.7为阈值)共5个,涉及基因共2 301个,对模块基因进行GO功能富集分析,结果表明主要富集以下功能上:信号转导、转运、细胞分化、翻译、细胞稳态、生物合成过程等.981品系与鲁龙1号品系的富集结果对比表明981品系在孢子放散过程中生物活性不高,生物合成水平较低,内环境稳态较差.经过KEGG富集,筛选到21个与981品系Ⅱ期四分孢子形成相关的备选基因,主要富集到DNA复制和染色体形态变化等与细胞周期相关的功能上,表明981品系在孢子形成时期的细胞分裂可能出现异常.本文结果为进一步深入揭示龙须菜四分孢子体发育分子调控机制提供思路和导向.