急性心肌梗死患者循环内皮细胞相关基因的生物信息学分析

• 作者: 余晶波 刘婷 姚麒 朱云云 林少沂
• 来源期刊: 现代实用医学
• 学科: 医学
• 关键词: 动脉粥样硬化 微阵列分析技术 内皮细胞 心肌梗塞 计算生物学
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 154-155,200,封3
• 页数: 4页
• 分类号: R542.2+2
• 字数: 1790字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-0800.2020.02.005

摘要

目的 应用生物信息学法对急性心肌梗死(AMI)患者外周血循环内皮细胞的相关基因进行分析.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载基因芯片数据集GSE66360,利用GEO2R、DAVID及STRING等分析平台筛选差异表达基因,并进行基因本体(GO)分析、信号通路(KEGG)分析及蛋白一蛋白相互作用网络(PPI)分析,应用Cytoscape软件进行模块分析并筛选核心基因.结果 共筛选出2个下调基因和80个上调基因,差异表达基因主要富集于免疫应答、炎症反应、碳水化合物类结合、细胞外基质、细胞因子-细胞因子受体相互作用等生物学过程;识别出的9个核心基因中,IL1B、SLC11A1及LILRB2为显著上调的差异基因,CCR2为下调基因.结论 AMI时循环内皮细胞出现表达变化的基因功能主要富集在免疫应答、炎症反应、碳水化合物类结合、细胞外基质、细胞因子-细胞因子受体相互作用等生物学过程,其中显著变化的核心基因IL1B、SLC11A1、LILRB2及CCR2可能发挥着重要作用,可能是AMI的预防和治疗的靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱云云		14	66	4.0	8.0
2	林少沂		3	9	1.0	3.0
3	姚麒		14	80	6.0	8.0
4	刘婷		6	12	2.0	3.0
5	余晶波		3	1	1.0	1.0