猪hnRNPUL1基因克隆及变异剪接体鉴定

• 作者: 刘东宇 刘娣 宋艳芳 张彩霞 杜芳芳 杨秀芹 马骏杰
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪 hnRNPUL1 克隆 变异剪接体
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 443-451
• 页数: 9页
• 分类号: S828.2
• 字数: 4796字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2020.03.005

摘要

旨在克隆民猪hnRNPUL1基因全长编码区(complete coding sequence,CDS)序列并进行可变剪接分析,研究其组织表达和亚细胞定位情况.本研究以3头3月龄民猪为试验材料,利用RT-PCR技术克隆hnRNPUL1基因CDS及可变剪接体,应用qRT-PCR检测其在心、肝、脾、肺、肾、胃、大肠、小肠、背肌、腿肌等组织中的表达情况,同时,在生物信息学预测的基础上,通过融合表达绿色荧光蛋白的方法鉴定核定位序列.研究结果表明,猪hnRNPUL1基因(GenBank accession No.:MN399154) CDS全长2 580 bp,预期编码的多肽链存在着hnRNPs家族的特征性结构域——SAP、SPRY和AAA;猪hnRNPUL1普遍表达于所检测的各组织中,其中在脾脏中表达量最高,在腿肌中表达量最低;核定位序列(NLS)位于多肽链的133～430 aa处,与生物学信息学预测的结果存在着偏差;同时获得了2个变异剪接体和11种可变剪接片段.本研究结果对进一步揭示猪hnRNPUL1基因功能及转录调控机制提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨秀芹	东北农业大学动物科学技术学院	60	300	9.0	14.0
2	刘娣		251	803	12.0	15.0
3	宋艳芳	东北农业大学动物科学技术学院	4	3	1.0	1.0
4	张彩霞	东北农业大学动物科学技术学院	3	1	1.0	1.0
5	杜芳芳	东北农业大学动物科学技术学院	1	0	0.0	0.0
6	马骏杰	东北农业大学动物科学技术学院	1	0	0.0	0.0
7	刘东宇	东北农业大学动物科学技术学院	2	1	1.0	1.0