黄花菜生物钟基因HcLHY的克隆及时空表达分析

• 作者: 亢秀萍 侯非凡 公菲菲 李森 杜崴 高阳
• 来源期刊: 河北农业大学学报
• 关键词: 黄花菜 生物钟 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 页码范围: 37-44
• 页数: 8页
• 分类号: S682.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2020.0049

摘要

为解析黄花菜LHY基因的开花时间生物学功能和调控机理,本试验以大同黄花(Hemerocallis citrina cv.'DatongHuanghua')为材料,通过转录组数据库检索和PCR技术克隆了黄花菜生物钟基因HcLHY,分析了该基因的生物信息学、系统发育和时空表达特性.结果 表明:该基因cDNA全长共计1 929 bp,编码642个氨基酸,蛋白相对分子量为69 470.67 D,理论等电点(pI)为5.82.生物信息学预测其为亲水蛋白,不具有跨膜结构域;其为转录因子,定位于细胞核中,不具备信号肽,该基因所编码蛋白的N端具有典型的Myb DNA-binding保守结构域;系统发育分析显示,HcLHY蛋白与芦笋AoLHY(XP_020245416.1)亲缘关系最近,同时发现不同植物的LHY蛋白保守结构域也有较高的相似性,在被子植物生物钟系统中的功能高度保守;时空表达特性分析HcLHY基因在开花前-12 h表达量最高,且在花瓣中表达量最高,显著高于叶片、雌蕊、雄蕊、花萼及根.此结果为以黄花菜为生物钟模式植物的分子生物学研究提供了借鉴,为进一步通过遗传和外源影响开花时间调控黄花菜采收提供理论依据.