基于DNA条形码技术的浮游动物休眠卵种类鉴定:以洞庭湖流域常德柳叶湖为例

• 作者: 于文波 崔宗斌 杨宇峰 梁迪文 王庆 魏南
• 来源期刊: 湖泊科学
• 关键词: 浮游动物 休眠卵 DNA条形码技术 COⅠ基因 洞庭湖流域 柳叶湖
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 页码范围: 154-163
• 页数: 10页
• 字数: 6650字
• 语种: 中文
• DOI: 10.18307/2020.0115

摘要

以洞庭湖流域的典型城市湖泊常德柳叶湖表层沉积物中浮游动物休眠卵为研究对象,采用DNA条形码技术进行种类鉴定,从191个休眠卵中成功获得101条有效序列,鉴定成功率约为53％.根据NCBI数据库比对成功鉴定休眠卵9科12属11种,另有6个样品鉴定到属或科;3个类群的种间遗传距离平均为种内遗传距离的68倍,表明可以利用线粒体细胞色素c氧化酶第一亚基编码基因(COⅠ)对休眠卵进行有效物种鉴定.通过Neighbor-Joining树进行系统发育分析,发现所鉴定的物种与其参比序列聚类为一支,所有物种分别聚为独立的一个支系,不同物种可有效区分.研究结果均表明,COⅠ基因作为DNA条形码可以实现沉积物中浮游动物休眠卵的物种鉴定.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨宇峰	暨南大学生态学系	74	1278	21.0	32.0
2	崔宗斌	中国科学院水生生物研究所	9	198	7.0	9.0
3	王庆	暨南大学生态学系	20	301	8.0	17.0
4	于文波	暨南大学生态学系	1	0	0.0	0.0
5	魏南	暨南大学生态学系	5	6	2.0	2.0
6	梁迪文	暨南大学生态学系	2	0	0.0	0.0