基于TMT标记定量蛋白组学分析SATB1过表达前后鼻咽癌细胞中差异蛋白质及信号富集

• 作者: 伍彩霞 封慕茵 揭伟 李汝佳 申志华 袁建玲 贾亚楠 邵钟铭 邹园
• 来源期刊: 中国病理生理杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 鼻咽癌 SATB1蛋白 TMT标记定量蛋白组学 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 短篇论著
• 页码范围: 346-353
• 页数: 8页
• 分类号: R730.23|R739.6
• 字数: 4902字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4718.2020.02.023

摘要

目的:分析富含AT序列的特异性核基质区结合蛋白1(SATB1)表达改变对人鼻咽癌(NPC)细胞中蛋白表达谱特征的影响,并采用生物信息学富集分析差异信号通路.方法:利用SATB1过表达慢病毒和阴性对照慢病毒感染CNE1细胞,获得稳定表达细胞系.提取2组细胞的总蛋白,利用TMT标记蛋白定量技术和串联质谱分析技术筛选出差异表达蛋白,采用RT-qPCR对差异蛋白编码基因在mRNA水平进行定量验证;应用GO数据库对差异表达蛋白进行注释和富集分析,应用 KEGG 数据库对差异蛋白涉及信号通路进行富集分析.结果:SATB1过表达慢病毒感染CNE1细胞后获得稳定表达细胞系.与对照组相比,过表达SATB1的CNE1细胞鉴别出278个差异表达蛋白,其中115个表达上调,163个表达下调;采用RT-qPCR对10个代表性差异蛋白的编码基因进行mRNA水平的验证,其结果与蛋白组学结果具有一致性. GO数据库分析差异表达蛋白主要参与了细胞过程、单有机体过程、生物调控和代谢过程,发挥生物分子结合和催化等分子功能;细胞组件主要存在于细胞部分、细胞以及细胞器上. KEGG数据库分析显示差异表达蛋白参与和肿瘤关系密切的信号通路,主要有 MAPK、PI3K-Akt、AMPK、JAK-STAT、p53、PPAR、Hippo和HIF-1通路等.结论: SATB1过表达后明显改变了NPC细胞中蛋白表达谱并影响多条与肿瘤关系密切的信号通路.蛋白组学筛查也为NPC的发病分子机制、治疗和预后标靶筛查提供了可能的宏观手段.