利用SNP分子标记构建50份糯玉米自交系DNA指纹库

• 作者: 卢媛 孙小淋 施标 沈雪芳 田东 韩晴
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 糯玉米 自交系 DNA指纹库 SNP标记
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子遗传学
• 页码范围: 15-19
• 页数: 5页
• 分类号: S513
• 字数: 3090字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15955/j.issn1000-3924.2020.03.03

摘要

为构建糯玉米品种DNA指纹库,保护品种资源,利用Illumina公司研发的包含56 110个SNP标记的芯片,对50份糯玉米自交系进行基因分型.结果 表明:按照SNP标记选用标准,共得到42 406个SNP标记.这些标记的杂合率均值为0.04,SNP缺失率均值为0.01,最小等位基因频率(MAF)均值为0.4,多态性信息含量(PIC)均值为0.38,基因多样性指数均值为0.44.对上述获得的SNP标记设置不同数量位点进行筛选,确定25 000位点为核心标记位点,可用于构建糯玉米自交系DNA指纹库.在25 000位点时,对50份糯玉米自交系进行SNP聚类分析,共将其划分为四大类群,聚类结果与品种系谱来源一致.该研究可为糯玉米品种特异性和一致性的鉴定分析及品种保护工作提供理论指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙小淋	上海市农业科学院生态环境保护研究所	17	20	3.0	4.0