玉米野生近缘种大刍草幼苗叶片的转录组SSR分析

• 作者: 刘强 张丽光 王创云 王陆军 赵丽 邓妍 郭虹霞
• 来源期刊: 玉米科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 大刍草 转录组 SSR 分子标记
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·品种资源
• 页码范围: 69-75
• 页数: 7页
• 分类号: S513.035.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.13597/j.cnki.maize.science.20200210

摘要

通过对大刍草转录组测序来发掘SSR标记位点,结果发现14 099个SSR位点,出现频率为13.31％.三核苷酸和单核苷酸是主要重复类型,分别占SSR总数的42.12％和25.65％;六核苷酸重复所占比例最小,占0.43％.转录组结果表明,大刍草SSR中共发现38种重复基元,单核苷酸重复基元A/T出现频率最高,占总SSR的21.06％;其次为AG/CT和GCC/GGC,分别占6.759％和5.53％.5次重复的SSR数量最多,有3 927个,占总SSR的27.85％.研究结果为大刍草的SSR分子标记研究、遗传多样性分析、种群遗传结构等提供基础.