基于叶绿体DNA分析的楸子种质遗传多样性研究

• 作者: 丛佩华 张彩霞 朴继成 李连文 王大江 王昆 高源
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 楸子 叶绿体DNA 单倍型 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 853-863
• 页数: 11页
• 分类号: S661
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0609

摘要

利用4对叶绿体DNA引物扩增49份楸子[Malus prunifolia (Willd.) Borkh.]种质资源的4个叶绿体DNA基因间区trnH-psbA、trnS-trnG spacer+ intron、trnT-5'trnL和5'trnL-trnF序列,基于4个叶绿体DNA基因间区的序列变异,从母系遗传的角度评价楸子的遗传多样性水平.结果 显示:4个叶绿体DNA基因间区序列经测序、拼接、比对和合并之后的片段长度为3 790 bp,共有173个多态性变异位点,其中包含2个单一突变位点、20个简约信息位点和151个插入/缺失位点.在49份楸子种质中,trnH-psbA、trnS-trnG spacer+intron、trnT-5'trnL和5trnL-trnF区域的变异位点的数量分别为26个、25个、120个和2个,单倍型数量分别为9个、7个、8个和3个,合并之后的叶绿体DNA片段的单倍型有14个.核苷酸多样性和单倍型多样性最高的区域均为trnH-psbA (Hd=0.775,Pi=0.02143),最低的为5'trnL-trnF(Hd=0.481,Pi=0.00072).49份楸子种质4个叶绿体DNA区域合并后的遗传多样性较高(Hd=0.854,Pi=0.00949).Tajima's D检验中,4个叶绿体DNA区域在P＞0.10水平上均不显著,楸子的4个叶绿体DNA区域在进化上遵循中性进化模型.楸子的遗传变异主要存在于群体内部,不同居群间基因交流频繁,多数居群间遗传分化较少,与地理距离不完全相关.