基于SSR序列的江西省不同生态地区稻瘟病菌遗传多样性分析

• 作者: 兰波 孙强 李湘民 杨迎青 霍光华
• 来源期刊: 植物保护学报
• 关键词: 稻瘟病菌 遗传多样性 SSR标记 遗传分化
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 292-301
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13802/j.cnki.zwbhxb.2020.2019117

摘要

为明确江西省稻瘟病菌Magnaporthe oryzae群体遗传结构及其多样性水平,选用13对SSR引物对分离自5个不同生态地理县(市)水稻穗颈瘟标样的稻瘟病菌单孢菌株的全基因组进行PCR扩增,利用最长距离法和POPGENE32生物学软件对其进行聚类分析和群体遗传多样性分析.结果 显示,共分离获得189株稻瘟病菌菌株,13对SSR引物对其均能扩增出l条大小相同且清晰的条带,多态性位点百分率高达100.00％.供试189株稻瘟病菌菌株在相似系数为0.74时可划分为15个遗传宗谱,其中宗谱JXL01包含71株菌株,占总菌株数的37.57％,为优势宗谱;宗谱JXL02、JXL14为亚优势宗谱,分别包含31、26株菌株,占总菌株数的16.40％和13.76％;宗谱JXL03、JXL08、JXL10为次要宗谱,包含10～17株菌株;其它9个宗谱为小宗谱,包含菌株都在5株以下.在群体水平上,来源于不同生态型地区的5个稻瘟病菌群体的Nei's基因多样性指数为0.375,Shannon信息指数为0.558,具有丰富的遗传多样性,且群体间差异较大;这5个种群基于非加权配对平均法大多聚为一类,种群遗传谱系与地理区域分布呈一定相关性,群体遗传多样性均值为0.373,存在一定的遗传分化,且群体内多样性大于群体间多样性,总遗传变异的64.56％存在于群体内.表明江西省稻瘟病菌群体结构既包含明显的优势宗谱,又存在复杂多变的特异性小宗谱,遗传多样性丰富,且与地理分布有一定的相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨迎青	江西省农业科学院植物保护研究所	33	208	10.0	13.0
2	李湘民	江西省农业科学院植物保护研究所	73	531	14.0	18.0
3	兰波	江西农业大学菌物资源保护与利用江西省重点实验室	53	356	11.0	16.0
5	霍光华	江西农业大学菌物资源保护与利用江西省重点实验室	51	423	11.0	18.0