长链非编码RNA在正常皮肤、瘢痕、瘢痕癌组织中的表达差异

• 作者: 任利成 崔旭
• 来源期刊: 北华大学学报（自然科学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 长链非编码RNA 瘢痕 瘢痕癌 基因芯片
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 生物科学·基础医学
• 页码范围: 329-333
• 页数: 5页
• 分类号: R856
• 字数: 3606字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11713/j.issn.1009-4822.2020.03.009

摘要

目的 分析正常皮肤组织、瘢痕组织、瘢痕癌组织中lncRNAs的差异表达,为瘢痕癌相关LncRNAs功能研究、生物标志物筛选提供实验基础.方法 通过基因芯片技术,高通量获得正常皮肤组织、瘢痕组织、瘢痕癌组织中LncRNAs和mRNAs表达情况.筛选差异表达的LncRNAs,并应用RT-PCR方法 进一步验证芯片结果 .通过基因本体论(Gene Ontology,GO)分析及信号通路(Pathway)分析,分析差异表达的lncRNAs和mRNAs的功能分布.结果 瘢痕癌组织与邻近未癌变瘢痕组织比较,有477种LncRNA表达上升,1576种LncRNA表达下降.瘢痕癌组织与邻近正常皮肤组织比较,有1753种LncRNA表达上升,2435种LncRNA表达下降(差异倍数fold≥2.0,P<0.05).其中,125种LncRNA在正常皮肤组织、瘢痕组织、瘢痕癌组织中表达呈递增式增长,324种呈递减式下降(差异倍数fold≥2.0,P<0.05).GO分析发现:差异表达的mRNAs主要参与免疫反应、趋化功能、细胞周期、生长调节、蛋白结合、蛋白质代谢等生理活动.Pathway分析发现:差异表达的mRNAs主要参与肿瘤蛋白P53途径、趋化因子途径、内质网蛋白加工途径以及黑素合成途径等.结论 瘢痕及瘢痕癌组织中差异表达的LncRNAs极可能与皮肤瘢痕增生及癌变密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任利成		36	96	6.0	8.0
5	崔旭		4	12	1.0	3.0