香蕉漆酶基因家族鉴定及低温胁迫下的表达分析

• 作者: 倪珊珊 刘彦英 赖钟雄 陈裕坤 项蕾蕾
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香蕉 漆酶家族 成员鉴定 生物信息分析 低温胁迫
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 837-852
• 页数: 16页
• 分类号: S668.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0626

摘要

为研究香蕉漆酶基因家族成员的功能,采用生物信息学方法鉴定香蕉漆酶基因成员,分析其低温胁迫下的表达情况,为香蕉抗寒研究提供理论依据.从香蕉A(Musa acuminata)基因组筛选了22条漆酶基因(MaLAC),从香蕉B(Musa balbisiana)基因组筛选了1 1条漆酶基因(MbLAC),通过生物信息分析发现MaLAC比MbLAC更保守.分子进化树分析结果表明MaLAC可分为5类,MbLAC可分为4类.启动子顺式作用元件分析结果表明,MaLAC启动子序列包含大量光响应、激素应答及非生物胁迫等应激响应元件,推测MaLAC基因家族在响应逆境胁迫的过程中发挥重要作用.利用qRT-PCR技术对MaLAC部分成员在响应不同低温胁迫的表达情况进行分析,MaLAC3-2、MaLAC4、MaLAC4-5、MaLAC17在低温(13、4、0℃)处理下表达量均极显著高于对照(28℃),推测可能在香蕉响应低温胁迫的过程中发挥重要作用.预测香蕉MaLAC家族有18个成员受miRNA调控,主要受miR397和miR408的调控;推测香蕉MaLAC可能参与miRNA调控途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	陈裕坤	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	48	97	5.0	7.0
3	项蕾蕾	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	8	2	1.0	1.0
4	刘彦英	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	4	0	0.0	0.0
5	倪珊珊	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	7	3	1.0	1.0