健康和患病克氏原螯虾肠道微生物群落结构和多样性分析

• 作者: 丁桂珍 喻运珍 张立强 李媛 罗杨志 艾桃山 邓平 魏朝辉
• 来源期刊: 水产科技情报
• 关键词: 克氏原螯虾 肠道微生物 优势菌 生物多样性 变形菌门
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 病害防治
• 页码范围: 37-40
• 页数: 4页
• 字数: 2240字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16446/j.cnki.1001-1994.2020.01.009

摘要

为探索健康克氏原螯虾(Procambarus clarkii)与患病克氏原螯虾在肠道微生物菌群结构和多样性方面的差异,采集健康虾(对照组)和患病虾(患病组)样品,通过Illumina高通量测序技术测定样品虾的肠道微生物组成,并利用Simpson指数评估样品中微生物的多样性.结果显示:所有样品共检出400个种水平上的OTUs(operational taxonomic units),归属于25个门(phylum);对照组肠道微生物的优势菌为厚壁菌门(Firmicutes),而患病组的优势菌为变形菌门(Proteobacteria).进一步分析表明,患病组变形菌门的占比显著高于对照组,Simpson指数提示,患病组的生物多样性较对照组显著下降(P<0.05).结果表明,患病克氏原螯虾肠道微生物中变形菌门的占比显著上升,生物多样性显著下降(P<0.05).