基于高通量测序技术筛选与山羊精子发生有关的lncRNAs

• 作者: 乔蕾 代子诺 何其杰 何莉娜 赵中权 黄思艺
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: lncRNA 山羊 精子发生 睾丸 测序
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 188-195
• 页数: 8页
• 分类号: S813.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.16303/j.cnki.1005-4545.2020.01.30

摘要

为了筛选出与精子发生有关的lncRNAs,本研究利用Illumina HiseQ 4000平台对山羊在出生期、初情期和成年期3个阶段的睾丸进行了lncRNAs测序分析.共产生了8 183个新的lncRNAs转录本.不同组间lncRNAs的差异表达分析显示,分别有1 167,5 392和5 465条lncRNAs转录本的表达有显著性差异,随机选择9个差异表达的基因进行qPCR验证,定量结果与测序结果一致.对lncRNAs的靶基因进行预测,其中5 477个编码蛋白的基因受到顺式作用调控,445个编码蛋白的基因受到反式作用调控.将差异显著的lncRNAs的靶基因进行了GO功能富集分析和KEGG途径富集分析,共有57个候选mRNA富集到精子发生功能中,它们分别靶向到50条新发现的lncRNAs,选出3个进行qPCR验证发现其在不同时期差异显著且表达趋势与靶基因一致,推测这些lncRNAs可能对靶基因有调控作用.该研究为进一步了解lncRNAs在睾丸发育和精子发生中的功能和机制提供了数据支持,极大地缩小了与精子发生相关lncRNA的研究范围,为揭示雄性的生殖功能提供了重要靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵中权	西南大学动物科技学院	37	125	6.0	10.0
2	何莉娜	西南大学动物科技学院	2	0	0.0	0.0
3	黄思艺	西南大学动物科技学院	2	0	0.0	0.0
4	乔蕾	西南大学动物科技学院	2	0	0.0	0.0
5	代子诺	西南大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0
6	何其杰	西南大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0