谷瘟病菌无毒基因PWL家族检测及变异分析

• 作者: 任世龙 全建章 李志勇 王永芳 王璐 申浩冉 白辉 董志平
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 谷子 谷瘟病菌 PWL基因家族 基因克隆 无毒基因
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 资源环境·植物保护
• 页码范围: 178-183
• 页数: 6页
• 分类号: S432.4+1
• 字数: 3622字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190568

摘要

为了确定不同地区谷瘟病菌群体中无毒基因PWL家族的分布和变异情况,从全国谷子主产区的不同区域采集分离了252株谷瘟病菌单孢菌株,提取基因组DNA,参考目前已知稻瘟病菌中无毒基因PWL家族的核苷酸序列开发合成了5对引物,通过PCR扩增对252株谷瘟病菌进行PWL家族基因检测,并对扩增片段进行测序分析.结果表明,252个谷瘟病菌菌株都不包含PWL1基因,65个菌株包含出PWL2基因,扩增率25.8％,252个菌株都包含PWL3与PWL4基因,扩增率100％.谷瘟病菌PWL3基因与稻瘟病菌中同源基因相比,在基因编码区存在849 bp的碱基插入,插入片段与non-LTR retrotransposon:MGL的相似度为96.7％,利用此差异可通过PCR技术快速区分谷瘟病菌与稻瘟病菌.谷瘟病菌PWL2基因存在多处单核苷酸变异,通过分析将其划分14个单倍型,分别为P1～P14.单倍型P1占绝对优势包含46个菌株,以此为基础衍生出其他主要单倍型,其次为单倍型P12包含7个菌株,并且多地区都存在特异性单倍型,说明我国谷瘟病菌种群具有较高的遗传多样性.谷瘟病菌中不存在PWL1无毒基因,PWL2无毒基因仅存在部分菌株中,PWL3和PWL4无毒基因存在所有谷瘟菌株中,PWL3和PWL4无毒基因对应的抗病基因在谷子上有重要的应用价值.