TIMP1与EFEMP1在直肠癌中的表达水平及预后意义

• 作者: 李佳佳 练国达 谭莹 陈少杰 陈尚祥 陈茵婷 黄开红
• 来源期刊: 岭南现代临床外科
• 学科: 医学
• 关键词: TCGA TIMP1 EFEMP1 EMT 直肠癌 预后
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 论著与临床研究
• 页码范围: 161-166
• 页数: 6页
• 分类号: R735.3+7
• 字数: 2642字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-976X.2020.02.006

摘要

目的 运用TCGA数据库,分析组织金属蛋白酶抑制剂-1(TIMP1)在直肠癌中的表达情况,及与直肠癌预后的关系.分析与TIMP1高表达组与低表达组差异基因的分子功能及生物学功能.分析TIMP1与EFEMP1的关系,EFEMP1与直肠癌预后的关系.方法 下载TCGA数据库中直肠癌相关数据,分析TIMP1在癌旁组织与直肠癌组织中的表达差异.分析不同临床分期患者的TIMP1表达水平.Kaplan-Meier生存曲线分析TIMP1表达量与直肠癌患者总体生存时间(OS)和无瘤生存时间(PFS)的关系.根据TIMP1表达水平,将直肠癌病人分为TIMP1高表达与低表达组,分析两组差异基因.对差异基因进行富集分析及通路分析,从而探索TIMP1相关基因的功能.寻找与TIMP1密切相关的基因,分析其与TIMP1的相关性,分析其与直肠癌预后的关系.结果 与癌旁组织比较,TIMP1在直肠癌组织中呈高表达,Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅳ期患者的TIMP1水平比对照组高.TIMP1表达水平越高,患者总体生存时间与无瘤生存时间越短,预后越差.基因富集结果显示,TIMP1高表达组与低表达组的差异基因,大多参与细胞黏附,维持细胞外基质稳定性等生物学过程.通路分析结果显示,差异基因在功能上与参与上皮-间质转化(EMT)的基因存在密切关联.其中含表皮生长因子的纤维蛋白样细胞外基质蛋白1(EFEMP1)基因与TIMP1呈正相关,EFEMP1表达越高,直肠癌患者总体生存时间和无瘤生存时间越短,预后越差.结论 TIMP1在直肠癌中高表达,与预后呈负相关.TIMP1与EFEMP1呈正相关;EFEMP1基因在直肠癌中与预后呈负相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄开红	中山大学孙逸仙纪念医院消化科	76	445	11.0	18.0
2	陈茵婷	中山大学孙逸仙纪念医院消化科	14	28	3.0	4.0
3	练国达	中山大学孙逸仙纪念医院消化科	8	9	2.0	2.0
4	陈少杰	中山大学孙逸仙纪念医院消化科	8	4	1.0	1.0
5	谭莹	中山大学孙逸仙纪念医院消化科	9	86	3.0	9.0
6	李佳佳	中山大学孙逸仙纪念医院消化科	2	1	1.0	1.0
7	陈尚祥	中山大学孙逸仙纪念医院消化科	2	0	0.0	0.0