马铃薯全生育期内根际微生物组变化规律

• 作者: 张义正 方志荣 清源 赖先军 颜朗
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 马铃薯 根际微生物组 生育期标记 群落动态
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 246-260
• 页数: 15页
• 语种: 中文
• DOI: l0.13343/j.cnki.wsxb.20190138

摘要

[目的]陆生植物根际环境与土壤中的微生物菌群关系密切,其根际微生物群落动态极可能直接影响着植物健康及养分高效利用.虽然根际益生菌已被证实可用于提高作物生产力,但由于缺乏对这些菌群组成动态变化规律的认识了解,它们的开发受到限制.研究马铃薯全生育期根际菌群的动态变化规律,探讨根际菌群变化与马铃薯发育时期的相关性,为针对马铃薯不同生长时期开发专用生物益生菌肥奠定理论基础.[方法]本研究着眼于马铃薯田间全生命周期微生物组动态变化,通过Illumina MiSeq高通量测序技术对不同时间点马铃薯根际细菌16S rRNA基因V3-V4区和真菌ITS区测序并对操作分类单位(OTU)进行聚类,分析样品间微生物群落的多样性特征,并通过机器学习的方法建立模型,将根际菌群与田间马铃薯发育时间相关联.[结果]根际菌群在马铃薯各个发育阶段随时间变化明显,营养生长阶段的微生物群落结构发生了显著变化,随着结薯期的开始逐渐稳定,直到块茎成熟后期根际菌群再次出现较大变化,且在不同施肥处理间呈现较大差异.进一步基于模型挖掘了与马铃薯发育时间相关联的22个特征细菌类群和16个特征真菌类群,其中苗期和结薯末期的特征类群分别为梭菌(Clostridium)和放线菌(Actinobacteria).[结论]马铃薯的生长发育时期是影响根际微生物群落组成的主要因素,益生菌肥的添加主要影响马铃薯结薯末期的细菌微生物菌群结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张义正	四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室	150	2059	26.0	38.0
2	方志荣	西昌学院农业科学学院四川马铃薯高等学校重点实验室	4	0	0.0	0.0
3	清源	西昌学院农业科学学院四川马铃薯高等学校重点实验室	2	0	0.0	0.0
4	赖先军	西昌学院农业科学学院四川马铃薯高等学校重点实验室	2	0	0.0	0.0
5	颜朗	西昌学院农业科学学院四川马铃薯高等学校重点实验室	2	0	0.0	0.0