夏天无对新型冠状病毒肺炎的网络药理学和分子对接研究

• 作者: 吴晨 葛珊 高慧琴 魏昀
• 来源期刊: 中医药信息
• 学科: 医学
• 关键词: 夏天无 新型冠状病毒肺炎 网络药理学 分子对接
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 新冠专题
• 页码范围: 104-111
• 页数: 8页
• 分类号: R285.5
• 字数: 5238字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19656/j.cnki.1002-2406.200084

摘要

目的:通过网络药理学和分子对接方法讨论夏天无对新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)的作用机制.方法:通过TCMIP和GeneCards数据库检索得到COVID-19的疾病靶点,并在TCMSP数据库检索夏天无的成分并参照筛选标准:OB ≥30％和DL≥0.18筛选活性成分,借助Swiss Target Prediction数据库检索其活性成分作用靶点,再通过VENNY2.1平台映射夏天无活性成分作用靶点和COVID-19疾病靶点的相同部分以获得重要靶点,并使用Cytoscape3.2.1软件将其与活性成分与重要靶点构建“中药-活性成分-重要靶点-疾病”网络以分析核心靶点和重要成分;同时,借助STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络以辅助筛选核心靶点;最终将核心靶点导入DAVID数据库和Cytoscape3.2.1软件,得到相关KEGG信号通路和Go生物过程并筛得核心成分.以此为基础,分析核心成分对SARS-CoV-2病毒的COVID-19 (6y84)构型的分子对接情况.结果:1)检索得到723个与COVID-19相关的疾病靶点;2)检索得到夏天无含有8个活性成分,可作用于853个(400种)靶点;3)夏天无可作用于COVID-19的重要靶点75个;4)夏天无可作用于COVID-19的核心靶点35个;5)得到与核心靶点相关的KEGG通路共17条,其中P＜0.01的重要信号通路共有4条,P＜0.01的生物过程53条.核心成分可与COVID-19 (6y84)形成构象能量较低、结构稳定的对接.结论:夏天无具备治疗COVID-19的成分物质基础,值得进一步研发.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高慧琴	甘肃中医药大学药学院	72	516	11.0	21.0
2	吴晨	甘肃中医药大学药学院	11	4	1.0	2.0
3	魏昀	甘肃中医药大学药学院	7	0	0.0	0.0
4	葛珊	甘肃中医药大学药学院	3	0	0.0	0.0