脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因的克隆及其表达特征分析

• 作者: 孙金秋 徐莞媛 欧阳乐飞 阎斌伦 马杭柯 高威 高焕
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 脊尾白虾 丝氨酸羟甲基转移酶基因 基因克隆 组织表达 Cd2+胁迫
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 127-134
• 页数: 8页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4502字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19663/j.issn2095-9869.20181229001

摘要

本研究根据脊尾白虾Exopalaemon carinicauda)转录组序列,采用cDNA末端快速扩增技术克隆获得了脊尾白虾丝氨酸羟甲基转移酶基因(SHMT).该基因cDNA全长为1855 bp,其中,开放阅读框为1407 bp,5'端非编码区为39 bp,3'端非编码区为409 bp,共编码468个氨基酸,预测蛋白质的分子质量为152.55kDa,理论等电点为4.90.同源性分析显示,脊尾白虾SHMT基因与甲壳类动物真宽水蚤(Eurytemora affinis)同源性最高,为96％.荧光定量分析结果显示,SHMT基因在脊尾白虾眼柄、胃、肝胰腺、心脏、鳃、肠、肌肉、腹索神经、皮下脂肪以及卵巢中均有表达,其中,卵巢表达量最高,心脏次之.不同浓度Cd2+胁迫结果显示,其在低浓度(0.0100、0.0175和0.021 mmol/L)Cd2+胁迫中的表达模式基本一致,呈先升高后下降再升高再下降的趋势;而在高浓度(0.0278 mmol/L)Cd2+胁迫中,该基因表达量很低,甚至不表达,说明高浓度Cd2+胁迫可以抑制该基因的表达,具体机制有待进一步研究.