35株非洲猪瘟病毒全基因组序列的系统生物学分析

• 作者: 丰志华 于婷婷 张扬帆 林章 陈江华
• 来源期刊: 福建农业科技
• 学科: 农学
• 关键词: 非洲猪瘟病毒 全基因组序列 系统生物学 病毒进化
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 12-19
• 页数: 8页
• 分类号: S852.651
• 字数: 2951字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13651/j.cnki.fjnykj.2020.05.002

摘要

非洲猪瘟(African Swine Fever,ASF)源于非洲猪瘟病毒(African Swine Fever Virus,ASFV)感染所引起的烈性传染病,主要是以蜱和野猪为天然宿主.ASFV感染能够导致家猪及野猪直接死亡,死亡率近乎100％.目前在非洲 、 欧洲 、 亚洲等地区均出现大面积爆发,却尚未出现对该病毒进行预防的商业化疫苗.因此,需要对病毒基因组信息有更深入的了解.通过对不同地区发生的ASFV全基因组进行多序列比对 、 系统进化树构建 、 保守区域检测等,获得与ASFV毒力 、 进化等相关的基因片段,并研究这些基因片段在不同区域的病毒株中的关系.结果表明:Ⅶ 与 Ⅱ 基因型相比较,后者出现很多大片段基因序列的增加,这些增加的片段主要出现在V110、360、505/530多基因家族中.其中,对多基因家族中MGF 505/530-7R、MGF 360-1L基因研究分析表明,不同基因型之间由于这些基因的差异影响巨噬细胞的存活能力 、 病毒复制强弱与病毒变异和进化有关,结果为研究病毒进化及未来病毒疫苗研发提供新的方向.