胡杨异形叶差异表达miRNA及其靶基因功能分析

• 作者: 何书航 冯军 曾明 李文海 赵媛媛 郑彩霞
• 来源期刊: 北京林业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 胡杨 异形叶 miRNA 高通量测序 差异表达
• 年，卷（期）: 2020,（6）
• 所属期刊栏目: 林学
• 页码范围: 1-13
• 页数: 13页
• 分类号: S718.43|S792.119
• 字数: 8649字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12171/j.1000?1522.20190464

摘要

[目的]异形叶性是植物为适应环境在同一植株上产生多种形态成熟叶片的现象.胡杨是典型的木本异形叶植物,前人研究发现,胡杨异形叶片间展现出不同的生理特性及环境适应性.本研究拟通过对胡杨异形叶差异表达miRNA及其靶基因功能的分析,揭示胡杨叶片形态及其生理变化的分子调控机制.[方法]以成年胡杨披针形叶和锯齿卵圆形叶为实验材料,通过高通量测序对其miRNA的表达模式及差异表达miRNA的靶基因功能进行比较研究.[结果]共获得6个高质量的sRNA文库,各文库有效序列占原始序列的56％～81％.通过比对,共鉴定517个已知miRNA和127个新预测miRNA,主要长度分布区间为20～22 nt,其中的389个miRNA匹配至54个已知的miRNA家族.两种形态叶片共同检出的miRNA有369个,与披针形叶片相比,锯齿卵圆形叶中7个miRNA上调表达,15个下调表达.通过靶基因预测及功能分析,发现差异表达miRNA参与调控胡杨异形叶的抗逆相关途径,如对盐胁迫的响应,磷酸肌醇代谢,角质、软木脂和蜡的生物合成,碱基切除修复和RNA降解等代谢途径.利用实时荧光定量PCR验证了5个差异表达miRNA的表达趋势与高通量测序结果一致,通过PCR检测发现差异表达miRNA与其靶基因存在一定的负调控关系.[结论]胡杨异形叶中miRNA表达模式存在差异.其中,调控植物生长发育的保守的miR167、miR166及调控植物抗逆性的miR172在锯齿卵圆形叶中表达量上调,参与植物逆境响应的保守的miR169、miR396在锯齿卵圆形叶中下调表达,推测差异表达miRNA引起了异形叶间形态的差异,同时使锯齿卵圆形叶对不利环境具有较强的耐受性.这与我们前期有关胡杨异形叶形态与生理特性的研究结果相一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑彩霞	北京林业大学生物科学与技术学院	85	920	17.0	27.0
2	赵媛媛	北京林业大学生物科学与技术学院	11	73	3.0	8.0
3	冯军	北京林业大学生物科学与技术学院	5	4	1.0	2.0
4	李文海	北京林业大学生物科学与技术学院	4	24	2.0	4.0
5	曾明	北京林业大学生物科学与技术学院	2	1	1.0	1.0
6	何书航	北京林业大学生物科学与技术学院	1	0	0.0	0.0