云南省西南地区4个口岸黄胸鼠种群遗传特性分析

• 作者: 刘莹莹 卢云兰 张晓龙 慈颖 方志强 曹晓梅 杨燕
• 来源期刊: 中国媒介生物学及控制杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 云南口岸 黄胸鼠 细胞色素b基因
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 451-456
• 页数: 6页
• 分类号: S443|R394.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2020.04.015

摘要

目的 掌握云南省4个口岸地区(金水河、磨憨、清水河、姐告)黄胸鼠种群遗传多样性和亲缘关系.方法 对2014-2015年在4个口岸地区捕获的55只黄胸鼠进行解剖,取其肝脏组织进行基因组DNA提取.应用PCR技术分析其线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因,通过生物信息学分析软件(Clustal X 2.0和MEGA 7.0)分析Cytb基因序列.计算Cytb基因序列的核苷酸、密码子组成以及使用频率,分析遗传距离并采用邻接法(Neighbour-Joining,NJ)构建系统进化树.结果 Cytb基因序列中碱基组成A+T约占59.77％,C+G约占40.23％.密码子UCA、CUA、CCA的使用频率分别为3.19％、3.11％和3.09％.姐告和清水河口岸黄胸鼠Cytb基因的遗传距离为0.000;金水河与清水河、姐告口岸黄胸鼠Cytb基因的遗传距离均为0.008.以小家鼠、褐家鼠为外群构建NJ进化树,清水河与姐告聚为一支,其次与磨憨,最后与金水河聚为一支.结论 Cytb基因序列中A+T含量明显高于C+G含量,黄胸鼠Cytb基因可能存在A+T偏倚性.遗传距离和NJ进化树分析表明清水河与姐告口岸黄胸鼠亲缘关系较近,其次是与磨憨黄胸鼠;金水河黄胸鼠与其他3个口岸黄胸鼠的亲缘关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	慈颖	中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所	28	76	6.0	7.0
2	张晓龙	中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所	27	55	4.0	7.0
3	曹晓梅	中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所	18	45	3.0	6.0
4	卢云兰		2	0	0.0	0.0
5	刘莹莹	中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所	1	0	0.0	0.0
6	杨燕	中国检验检疫科学研究院卫生检验与检疫研究所	1	0	0.0	0.0