南极菲尔德斯半岛潮间带沉积物细菌群落结构分析及产酶菌株初步筛选

• 作者: 史晓翀 吴蕾蕾 商丽 孙浩 张晓华
• 来源期刊: 极地研究
• 关键词: 菲尔德斯半岛潮间带沉积物 高通量测序 可培养细菌 16SrRNA基因 酶活性
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 512-522
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13679/j.jdyj.20190069

摘要

为了研究南极菲尔德斯半岛潮间带沉积物细菌群落组成及可培养细菌产酶活性,选取潮间带19个站位沉积物样品,利用Illumina MiSeq高通量测序技术对沉积物中细菌的群落组成进行研究;利用荧光定量PCR技术定量测量沉积物中总细菌的绝对丰度;利用传统的平板涂布法对16个站位的沉积物样品中可培养细菌进行纯化和鉴定,同时选取38株细菌进行酶活性筛选.结果显示:19个站位潮间带沉积物样品共得到2375个分类操作单元OTU(operational taxonomic unit),共获得42个细菌门,其中变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、放线菌门(Actinobacteria)为优势类群.总细菌的丰度介于2.51×107～6.65×108 copies·g–1.对于可培养细菌,129株测序的细菌分属于4个门,25个属,50个种.变形菌门、放线菌门、拟杆菌门为优势类群,这与高通量测序结果基本一致.选取其中38株进行酶活性筛选(包括脂酶、淀粉酶、明胶酶、褐藻胶酶和纤维素酶),发现17株可产脂酶、24株可产淀粉酶、18株可产明胶酶、4株可产褐藻胶酶和4株可产纤维素酶.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙浩		9	7	1.0	2.0
2	张晓华		59	630	15.0	23.0
3	史晓翀		13	60	5.0	7.0
4	吴蕾蕾		2	0	0.0	0.0
5	商丽		2	2	1.0	1.0