基于GEO和TCGA数据库分析着丝粒蛋白A在胰腺癌中的表达及其临床意义

• 作者: 向晓辉 李海 毛骏
• 来源期刊: 中华胰腺病杂志
• 关键词: 胰腺肿瘤 计算生物学 着丝粒蛋白质 生物学标记
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 184-189
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.cn115667-20200515-00074

摘要

目的 探讨着丝粒蛋白A(CENP-A)基因在胰腺癌中的表达、临床意义及其在胰腺癌发生发展中的作用.方法 分别从高通量基因表达(GEO)数据库的1个包含45例胰腺癌患者微阵列数据集(GSE28735)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库的1个包含177例胰腺癌患者数据集获得CENP-AmRNA表达谱和临床病理资料.采用生物信息学方法分析CENP-A在胰腺癌组织表达与临床病理指标的相关性以及对患者预后的影响.采用基因集富集分析(GESA)预测CENP-A在胰腺癌发生发展中调控的可能通路,同时结合STRING数据库中CENP-A蛋白质-蛋白质相关作用网络(PPI)筛选出与CENP-A相关的蛋白,并分析两者表达的相关性.结果 胰腺癌组织CENP-A mRNA的表达量显著高于癌旁组织,差异有统计学意义(4.492±0.361比3.431±0.405,P=0.001).胰腺癌组织CENP-A表达水平与肿瘤TNM分期和分级显著相关(P＜0.05).CENP-A高表达患者总体生存期显著低于CENP-A低表达患者(P＜0.05).CENP-A高表达的胰腺癌组织存在细胞周期和DNA复制两条通路基因集的富集(P＜0.01,错误发现率＜0.05).通过PPI网络分析发现胰腺癌组织CENP-A与周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、纺锤体检测蛋白1(BUB1)呈显著相关(r值分别为0.861、0.825,JP值均＜0.001).结论 胰腺癌组织CENP-A基因高表达与其恶性生物学行为有关,其机制可能是通过与CDK1、BUB1的协同作用实现.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李海	天津市西青医院消化内科	10	0	0.0	0.0
3	向晓辉	天津市西青医院消化内科	3	0	0.0	0.0