基于数据挖掘分析极光激酶A在食管癌中的表达及意义

• 作者: 张孟贤 张微 方呈祥 杨丽 熊英友 陈世勇
• 来源期刊: 癌变·畸变·突变
• 学科: 医学
• 关键词: 食管癌 数据挖掘 极光激酶A 预后
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 221-228
• 页数: 8页
• 分类号: R735.1
• 字数: 5664字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-616x.2020.03.012

摘要

目的:探讨极光激酶A(AURKA)在食管癌组织中的表达与功能,并分析其对患者生存预后的影响.方法:基于GEPIA及Oncomine数据库检索AURKA在食管癌组织与正常组织中的表达差异;通过STRING网络在线数据库构建有关AURKA的蛋白相互作用(PPI)网络,并将数据导入Cytoscape软件后采用CytoHubba分析插件筛选出核心基因;在GEPIA数据库中,基于TCGA和GTEx数据集分析AURKA与核心基因表达的相关性;采用DAVID网络分析工具对核心基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;基于R2基因分析可视化平台分析AURKA的表达与食管癌患者生存预后的关系.结果:GEPIA、Oncomine数据库分析显示,AURKA在食管癌组织中的表达较正常组织明显升高(P<0.05),但与患者肿瘤分期无关(P>0.05);AURKA与CDC20(r=0.78)、PLK1(r=0.83)等核心基因的表达呈显著正相关,其生物学功能主要富集于细胞分化、DNA损伤检测点、细胞增殖、负性调控细胞凋亡等;参与细胞周期调控、细胞衰老、P53以及FoxO等信号通路的调节;AURKA高表达组与低表达组患者相比预后较差,差异具有统计学意义(P<0.05),且核心基因CCNB1、BUB1B、NEK2高表达组患者的生存率也显著低于低表达组(P均<0.05).结论:AURKA在食管癌组织中表达升高,且高表达组患者预后不良;AURKA与CCNB1、NEK2等核心基因共同参与了肿瘤发生相关的功能与通路,AURKA有望成为食管癌患者早期诊断、治疗及判断预后的候选分子靶标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张孟贤	华中科技大学同济医学院附属同济医院肿瘤中心	37	274	7.0	16.0
2	方呈祥	湖北民族大学附属民大医院肿瘤科	18	67	5.0	8.0
3	熊英友	湖北民族大学附属民大医院肿瘤科	5	2	1.0	1.0
4	杨丽	湖北民族大学附属民大医院肿瘤科	4	0	0.0	0.0
5	张微	湖北民族大学附属民大医院肿瘤科	7	1	1.0	1.0
6	陈世勇	湖北民族大学附属民大医院肿瘤科	1	0	0.0	0.0