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miRNA-181b与骨髓增生异常综合征预后因素的关系及其靶基因预测
miRNA-181b与骨髓增生异常综合征预后因素的关系及其靶基因预测
作者:
仇鑫
周起
孙亮
宁尚勇
常乃柏
徐泽锋
秦铁军
艾晓非
范芸
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
微RNAs
骨髓增生异常综合征
预后
计算生物学
miRNA-181b
摘要:
目的 探讨miRNA-181b(miR-181b)与骨髓增生异常综合征(MDS)预后因素的相关性及预测的miR-181b靶基因主要生物学功能,评价miR-181b对MDS风险预测能力.方法 选择2019年1月至9月中国医学科学院血液病医院符合2016年世界卫生组织(WHO)诊断标准的131例MDS患者的骨髓样本,同时收集患者临床资料,包括血常规检查、血液疾病相关基因检测结果等,进行回顾性研究.应用荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测所有骨髓样本中miR-181b的表达量.根据国际预后评分系统(IPSS)、基于WHO分型的预后评分系统(WPSS)以及修订版IPSS(IPSS-R)三种评分系统将患者按不同危险度分组,比较各组患者miR-181b的表达差异,并分析部分预后评分因素[白细胞计数(wBc)、血红蛋白(Hb)、血小板计数(Plt)、中性粒细胞计数(ANC)、原始粒细胞比例、突变基因]与miR-181b表达的相关性.通过生物信息学在线工具TargetScan对miR-181b进行靶基因预测,并进行功能分析.结果 miR-181b表达量随IPSS、WPSS、IPSS-R危险度的升高均增加,且在各评分系统中不同危险度的患者间miR-181b表达量差异均有统计学意义(均P<0.01);miR-181b表达量与三种预后评分系统分数均呈正相关(r值分别为0.437、0.368、0.327,均P=0.001);miR-181b表达量与患者骨髓原始粒细胞比例呈正相关(r=0.450,P< 0.01),与Plt呈负相关(r=-0.199,P=0.024),与WBC、Hb、ANC以及是否有血液疾病相关基因突变均无相关性(均P> 0.05).生物信息学预测miR-181b潜在靶基因1 363个,主要富集的生物学过程有转录调控、RNA代谢过程的调控等,其中有22个靶基因与血液疾病相关,包括5个已证实的与MDS发病相关的基因(RUNX1、ASXL2、NRAS、ATM和KRAS);有血液疾病相关且为miR-181b靶基因的突变患者(32例)miR-181b相对表达量[中位数(P25,P75)]为1.33(0.63,1.60),高于无突变患者(99例)的0.85(0.49,1.38),差异有统计学意义(Z=2.285,P=0.022).结论 miR-181b与MDS预后评分系统危险度有相关性,其可能参与了MDS发病的分子生物学过程.
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篇名
miRNA-181b与骨髓增生异常综合征预后因素的关系及其靶基因预测
来源期刊
白血病·淋巴瘤
学科
关键词
微RNAs
骨髓增生异常综合征
预后
计算生物学
miRNA-181b
年,卷(期)
2020,(4)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
213-218
页数
6页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.cn115356-20200102-00005
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miRNA-181b
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
白血病·淋巴瘤
主办单位:
中华医学会
山西省肿瘤研究所
山西省肿瘤医院
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-9921
CN:
11-5356/R
开本:
大16开
出版地:
太原市职工新街3号
邮发代号:
22-107
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
4983
总下载数(次)
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