基于TCGA数据分析研究TMEM206在HCC中的表达及其与预后的相关性

• 作者: 冯豆 宋玲 张洪 范月莹 高洁芳
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 医学
• 关键词: 肝细胞癌 TMEM206 TCGA 生物标志物
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 247-254
• 页数: 8页
• 分类号: R735.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.16519/j.cnki.1004-311x.2020.03.0040

摘要

[目的]探讨TMEM206表达在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)诊断和预后中的价值.[方法]从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载肝细胞癌数据集表达谱及临床病理特征资料.采用Kaplan-Meier和Cox分析,观察TMEM206表达对肝细胞癌患者生存和预后的影响.使用TCGA数据集进行基因集富集分析(GSEA).[结果]TMEM206在HCC肿瘤组织中的表达高于癌旁组织(P ＜0.000 1),并且TMEM206的表达与HCC的肿瘤分级、肿瘤分期都有显著相关.生存分析结果表明TMEM206表达越高,HCC患者的总体生存时间越短.单因素和多因素Cox分析表明,TMEM206 mRNA的表达可能是判断HCC预后的有效生物标志物.GSEA鉴定了TMEM206在HCC中的高表达可能与泛素介导的蛋白质水解、胞吞作用、RNA降解、小细胞肺癌、癌症通路、胰腺癌、胞质DNA传感途径、慢性粒细胞白血病、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、细胞周期等反应有关.[结论] TMEM206 mRNA高表达是肝细胞癌的诊断和预后中的有效生物标志物.