照光抑制稻曲病菌菌丝生长的转录组分析

• 作者: 张璐 梁五生 胡东维 赵心雨 郭宇燕
• 来源期刊: 浙江大学学报（农业与生命科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 稻曲病菌 照光 转录组 差异表达基因
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 571-581
• 页数: 11页
• 分类号: S435.111.46
• 语种: 中文
• DOI: 10.3785/j.issn.1008-9209.2020.02.012

摘要

为探究稻曲病菌(Villosiclava virens)菌丝生长的调控因子及其调控机制,将稻曲病菌ZJ09菌株用马铃薯蔗糖琼脂(potato sucrose agar,PSA)平板培养基分别于黑暗和照光(日光灯提供的白光)条件下培养.结果显示:照光能显著抑制菌丝生长,说明光照条件是该菌菌丝生长的一种调控因子.采集上述2组菌丝进行转录组测序,共获得695个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中359个基因在照光后表达上调,336个基因在照光后表达下调.从DEGs中选取6个基因用实时荧光定量聚合酶链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)进行验证,所得结果与转录组测序结果一致.对DEGs进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析,结果491个DEGs得到富集,涉及生物过程、细胞成分和分子功能3大类别,说明照光抑制菌丝生长的机制较为复杂.对DEGs进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路注释,结果表明:照光抑制菌丝生长主要与核糖体结构和功能,以及氨基酸代谢受到影响有关.DEGs包含1个乙酰辅酶A合成酶编码基因,照光显著抑制该基因表达,据此推测,削弱菌丝的乙酰辅酶A合成能力可能是照光抑制菌丝生长的机制之一.由于UvHOG1和UvBI-1这2个基因都不是DEG,因此蛋白激酶HOG1(high osmolarity glycerol 1)和Bax抑制子1可能与照光对菌丝生长的抑制作用无关.