绵羊Izumo1基因多态性及其与产羔数关联分析

• 作者: 储明星 刘秋月 张效生 张金龙 汤继顺 狄冉 王翔宇 王金玉 田志龙 胡文萍 董新龙
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 绵羊 Izumo1基因 克隆 多态性 SNP 产羔数
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 页码范围: 95-104
• 页数: 10页
• 分类号: S826.8
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2020.01.11

摘要

为研究Izumo1基因多态性及与产羔数关系,本研究利用PCR和直接测序法对小尾寒羊和苏尼特羊的Izumo1基因DNA序列进行扩增、测序和BLAST分析,并和本课题组前期绵羊重测序数据进行比对,筛选出Izumo1基因SNP位点.同时,采用Sequenom MassARRAY(R)技术进行基因分型,并对其SNP位点的基因型和等位基因频率在各群体中的分布进行研究.结果 表明:小尾寒羊Izumo1基因DNA全长序列3 385 bp,苏尼特羊Izumo1基因DNA全长序列3 382 bp;筛选出8个Izumo1基因SNP位点,经过初步筛选,将在小尾寒羊、苏尼特羊、滩羊、萨福克羊、杜泊羊、草原藏羊这6个绵羊品种中位点分布没有差异的SNP位点排除,最终筛选获得的g.54412135A＞G和g.54412107C＞A 2个位点.Izumo1基因g.54412135A＞G位点在多羔和单羔绵羊品种中存在GG、GA和AA 3种基因型,G基因为优势等位基因;g.54412107C＞A在多羔品种中存在CC和CA 2种基因型,而在单羔品种中存在CC、CA和AA 3种基因型,C基因为优势等位基因,其基因型频率和基因频率在单、多羔绵羊群体间的分布差异均极显著(P＜0.01);群体遗传学分析得出g.54412135A＞G多态位点在6个品种中的多态信息含量(PIC)都属于低度多态(PIC＜0.25);g.54412107C＞A多态位点在杜泊羊中属于中度多态(0.25＜PIC＜0.5),在其他5个品种中都属于低度多态(PIC＜0.25),然而,关联分析发现Izumo1基因g.54412135A＞G和g.54412107C＞A位点的不同基因型与小尾寒羊不同胎次产羔数之间不存在显著关联(P＞0.05).