拟穴青蟹Cactus基因的cDNA克隆、序列及生物学功能

• 作者: 何建国 刘姗姗 李晶晶 李海云 翁少萍 胡蕾 邓恒为
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 拟穴青蟹 Cactus 基因克隆 组织分布 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（1）
• 页码范围: 21-32
• 页数: 12页
• 分类号: Q785|S917.4
• 字数: 7715字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20181211604

摘要

为获取拟穴青蟹Cactus基因cDNA全长、分析基本生物学信息,并初步探索其在病原物刺激下的免疫反应,实验采用RACE技术获得了拟穴青蟹Cactus(SpCactus)基因的cDNA全长序列,其cDNA全长为2035 bp,开放阅读框(ORF)1311 bp,编码436个氨基酸,分子量为46.01 ku.对蛋白理化性质进行预测发现,SpCactus为亲水性蛋白,等电点pI为4.91.经预测,SpCactus与其他物种的IκB蛋白具有相似的功能结构域.同源性比对结果显示,SpCactus与凡纳滨对虾和中国明对虾的Cactus蛋白同源性均高达62％,相似度为73％.系统进化树分析显示,SpCactus与甲壳动物聚为一支,与无脊椎动物聚为一大支.实时荧光定量PCR(RT-PCR)检测发现,SpCactus基因在拟穴青蟹不同组织中均有表达,肌肉中的表达量最高,其次为心脏、眼柄、血液和鳃,肝胰腺中的表达量最低.LPS和金黄色葡萄球菌刺激均能显著诱导SpCactus基因的表达.本实验成功扩增了SpCactus基因全长,并进行了生物信息学分析、理化性质预测,初步探讨了其生物学功能,为进一步研究其在免疫反应中的生物学功能提供参考依据.