飘鱼微卫星位点的筛选及珠江流域5个地理群体的遗传多样性分析

• 作者: 刘丽 徐姗楠 戴嘉格 李振海 李敏 邹柯姝 阮惠婷
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 飘鱼 微卫星 遗传多样性 珠江流域 分化
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 页码范围: 501-508
• 页数: 8页
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 5578字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2020.061

摘要

为了解珠江流域飘鱼(Pseudolaubuca sinensis)群体间的遗传多样性及其分化程度,利用RAD-Seq技术开发出微卫星位点,并设计了100对微卫星引物,筛选出66个可稳定扩增出目的条带的位点,其中16个具有较高的多态性(PIC>0.5),以2碱基重复居多.利用其中10对多态性位点对珠江流域的郁江(YuJ)、左江(ZJ)、右江(YJ)、融江(RJ)和桂江(GJ)飘鱼群体进行遗传多样性研究,得到有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度范围分别为5.2028—6.3800、0.6773—0.7667和0.7975—0.8425,表明珠江流域5个飘鱼群体具有较高的遗传多样性,以YuJ群体遗传多样性最高,RJ群体遗传多样性为最低.且群体间各个遗传参数相差较小,说明他们的遗传多样性水平相近.AMOVA分析显示,遗传变异主要来自于群体内(98.45％),仅一小部分的变异来自于群体间(1.55％),总群体的遗传分化系数Fst为0.015,两两群体间的Fst在–0.0033—0.0295波动,属于低等程度的分化.群体间基因交流值(Nm)在8.2246—76.0075,表明群体间基因交流频繁,对遗传漂变作用的抵制能力较强.研究筛选出了多态性高的微卫星位点,并利用其对5个飘鱼群体遗传多样性进行评价,旨在有效地监测飘鱼的种质资源状况,为其资源的开发利用和保护提供科学指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘丽	华南农业大学海洋学院	64	446	11.0	17.0
2	徐姗楠	中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室	16	81	5.0	8.0
3	李敏	中国水产科学研究院南海水产研究所农业农村部外海渔业开发重点实验室	7	37	4.0	6.0
4	阮惠婷	华南农业大学海洋学院	1	0	0.0	0.0
5	戴嘉格	华南农业大学海洋学院	1	0	0.0	0.0
6	李振海	华南农业大学海洋学院	1	0	0.0	0.0
7	邹柯姝	华南农业大学海洋学院	1	0	0.0	0.0