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休眠期后板栗混合花芽的转录组分析
休眠期后板栗混合花芽的转录组分析
作者:
余洁
李琳玲
查三省
程华
程水源
罗延延
肖贤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
板栗
混合花芽
转录组测序
功能注释
基因分析
摘要:
板栗是中国重要的木本粮食作物,具有极高的经济价值,但板栗雄花比例远远高于雌花,是限制板栗产量的主要因素.为了从分子水平上探讨板栗雌雄花的发生机制,本研究利用高通量测序技术对休眠期后板栗的两种混合花芽的转录组进行比较分析.总计获得了3 772个差异表达基因,其中2 173个基因上调,1 599个基因下调.这些差异基因经过GO分类和KEGG pathway富集分析分别归类于47个GO term和251条代谢途径.从转录组数据中获得了春化、光周期、赤霉素(GA)等途径的开花相关基因,还鉴定多个开花相关内源激素途径的基因.将基因VIN3,GAI,ELF3,GID1的qPCR检测结果与其转录组测序结果进行比对,发现虽然两种检测结果在差异倍数上存在差别,但4个基因的表达量的总体变化趋势一致,说明转录组测序结果有较高的可信性.本研究结果为揭示板栗雌雄花性别比例调控机制和花期人工调控提供了一定的科学参考.
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文献信息
篇名
休眠期后板栗混合花芽的转录组分析
来源期刊
分子植物育种
学科
关键词
板栗
混合花芽
转录组测序
功能注释
基因分析
年,卷(期)
2020,(5)
所属期刊栏目
甚因组学及功能基因
研究方向
页码范围
1447-1454
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13271/j.mpb.018.001447
五维指标
作者信息
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姓名
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程水源
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程华
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余洁
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板栗
混合花芽
转录组测序
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
分子植物育种
主办单位:
海南省生物工程协会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1672-416X
CN:
46-1068/S
开本:
大16开
出版地:
海南省海口市海秀大道128号双岛公寓13B室
邮发代号:
84-23
创刊时间:
2003
语种:
chi
出版文献量(篇)
7272
总下载数(次)
34
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