地黄核苷二磷酸激酶基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 宫世萌 李冰怡 李娇娇 李谦谦 段红英 郑雪
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 地黄 核苷二磷酸激酶( NDPK) 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 系统与进化
• 页码范围: 492-500
• 页数: 9页
• 分类号: Q943
• 字数: 4192字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201901005

摘要

核苷二磷酸激酶(NDPK)是一种高度保守的多功能蛋白,具有催化底物磷酸化的作用,能够参与植物的生长发育、非生物胁迫、感病应激、光合作用和能量代谢等过程.为了解地黄核苷二磷酸激酶基因(RgNDPKⅠ)的结构、功能和性质,该研究利用地黄转录组学数据,通过电子克隆的方法获得了RgNDPKⅠ基因的全长cDNA序列,长度为765 bp.生物信息学分析结果表明,RgNDPKⅠ基因的开放阅读框长度为447 bp,编码148个氨基酸,具有典型的核苷二磷酸激酶活性结构域和其他磷酸化活性位点.RgNDPKⅠ基因编码的蛋白质定位于细胞质,是无跨膜区域的亲水性蛋白,该蛋白质与芝麻、紫花风铃的核苷二磷酸激酶相似性较高,分别为97％和96％.在多种生物中已经克隆得到了核苷二磷酸激酶基因,且不同植物核苷二磷酸激酶氨基酸序列中存在多个相似的保守结构域,推测RgNDPKⅠ基因所编码的蛋白质为核苷二磷酸激酶超家族成员.该研究结果为进一步探明RgNDPKⅠ的性质、结构、功能及表达机制提供了重要的理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段红英	河南师范大学生命科学学院	45	382	11.0	16.0
2	郑雪	河南师范大学生命科学学院	2	2	1.0	1.0
3	李娇娇	河南师范大学生命科学学院	6	2	1.0	1.0
4	李冰怡	河南师范大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0
5	李谦谦	河南师范大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0
6	宫世萌	河南师范大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0