耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的生物学信息预测

• 作者: 张东军 王文艳 阿孜尔古丽·阿布都克日木
• 来源期刊: 中国校医
• 学科: 医学
• 关键词: 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 EsxA蛋白 表位 生物信息学
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 疾病控制
• 页码范围: 89-91,96
• 页数: 4页
• 分类号: R318.04
• 语种: 中文

摘要

目的 在线软件分析耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的生物学信息,为防治金黄色葡萄球菌感染提供理论基础.方法 采用在线分析系统蛋白质EXPASYP Protemic (http://www.espasy.org)中的Protparam (http://expasy.org/tools/protparam.html),分析耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的分子质量、分子式,氨基酸数目、等电点、正负电荷残基,预测该蛋白的稳定性等理化性质;利用在线分析蛋白质软件Protscale (http://www.espasy.org/cgibin/protscale.p1)分析EsxA蛋白亲(疏)水性;采用SOPMA软件预测和分析耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的二、三级结构.结果 EsxA蛋白二级结构α螺旋(Hh)占26.15％(68个),延伸链(Ee)占32.69％(85个),无规则卷曲(Cc)占33.46％(87个).蛋白分子质量为30428.46 ku;理论pI值为8.18;氨基酸序列Ala占1.9％,Arg占1.9％,Val占3.5％.可能是亲水性蛋白;预测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白的糖基化位点为71、87、146、176、200、243氨基酸处,预测存在1个丝氨酸、1个苏氨酸、3个酪氨酸磷酸化位点;同源建模中EsxA蛋白的GMQE值为0.75,Qmean向上手势,模型质量获得较高.结论 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌EsxA蛋白含有磷酸化位点和糖基化位点,具有免疫原性的基础结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阿孜尔古丽·阿布都克日木	新疆医科大学基础医学院	13	27	3.0	4.0