烟草青枯病抗性的全基因组关联分析

• 作者: 任民 何斌彬 杨爱国 耿锐梅
• 来源期刊: 中国烟草科学
• 关键词: 烟草 种质资源 青枯病 SNP 全基因组关联分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13496/j.issn.1007-5119.2020.05.001

摘要

为发掘并定位烟草青枯病抗性遗传位点,利用RAD简化基因组重测序技术(RAD-seq),以219份遗传多样性较高的国内外烟草品种作为供试自然群体,利用田间病圃鉴定供试材料的青枯病抗性,通过全基因组关联分析(GWAS),发掘抗病基因组区段,并进行抗病候选基因预测.结果表明,筛选鉴定到8个高抗青枯病的烟草品种,获得了384904个高质量的SNP位点,对烤烟群体的基因组连锁不平衡衰减(LD)距离进行了估算,平均为256 kb.在烟草基因组内发掘到1个与烟草青枯病抗性变异显著关联的区段,峰值SNP在17号染色体的23977382 bp处,p=6.196×10-7,能解释14.29％的表型变异,在该区段内预测到4个抗病候选基因.本研究为烟草青枯病抗病基因克隆及分子育种提供了较为明确的基因组定位信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨爱国	中国农业科学院烟草研究所	19	284	8.0	16.0
2	任民	中国农业科学院烟草研究所	16	216	9.0	14.0
3	耿锐梅	中国农业科学院烟草研究所	8	42	4.0	6.0
4	何斌彬	中国农业科学院烟草研究所	1	0	0.0	0.0