大白菜TPS基因家族鉴定及其在高温胁迫下的表达分析

• 作者: 周曼 孙晓东 庞强强 张文 蔡兴来
• 来源期刊: 分子植物育种
• 关键词: 大白菜(Brassica campestris L.) TPS基因家族 生物信息学 高温胁迫 表达分析
• 年，卷（期）: 2020,（8）
• 所属期刊栏目: 基因组学及功能基因
• 页码范围: 2452-2459
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13271/j.mpb.018.002452

摘要

为明确大白菜TPS (BrTPS)家族成员信息及对高温胁迫信号的响应,本研究利用生物信息学方法,在大白菜基因组数据库中鉴定了BrTPS基因家族成员,并对其理化性质、进化特征、蛋白结构及在高温胁迫下的表达模式进行分析.结果 表明,大白菜全基因组含有15个TPS基因家族成员,分布于8条染色体上.除BrTPS14和BrTPS15外,其余成员各含有1个TPS和1个TPP结构域,并且所含motif的排列顺序也完全一致.理化性质分析发现,15个成员的氨基酸长度介于129～1 459 aa之间,分子量大小在14.73～165.83 kD之间,大部分BrTPS蛋白为酸性蛋白和亲水蛋白,以无规则卷曲作为二级结构主要构成元件.进化分析表明,大白菜TPS基因家族成员可分为2类,其中Class Ⅰ包含5个成员,Class Ⅱ包含10个成员.本研究对高温胁迫前后不同组织和持续高温胁迫下叶片中的表达分析,发现大部分的BrTPS基因可对高温胁迫产生响应,但在表达规律上存在差异.这些研究结果为后续研究大白菜TPS基因提供一定参考.