油茶果实发育相关基因SPATULA/ALCATRAZ的鉴别

• 作者: 甘然 赵松子
• 来源期刊: 南方林业科学
• 关键词: 普通油茶 SPATULA ALCATRAZ 果实发育 果实大小
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 页码范围: 7-11
• 页数: 5页
• 分类号: S792.4|Q781
• 语种: 中文
• DOI: 10.16259/j.cnki.36-1342/s.2020.05.002

摘要

拟南芥(Arabidopsis thaliana)SPATULA/ALCATRAZ是与果实发育和果实大小有关的基因.对普通油茶(Camellia oleifera)幼叶、 未成熟种仁、 花蕾的转录组数据进行挖掘,得到2条油茶SPATULA基因序列和1条油茶ALCATRAZ基因序列;从油茶基因组三代测序数据中鉴别出含有前述3条序列的基因组DNA序列;最后,得到3条油茶SPATULA/ALCATRAZ基因全长CDS序列,分别命名为CoSPT1、CoSPT2、CoALC.用基部被子植物无油樟(Amborella trichopoda)的SPATULA及核心真双子叶植物53个SPATULA/ALCATRAZ蛋白质序列构建进化树,结果表明,CoALC与拟南芥AtALC分布在不同的亚支,CoALC在油茶中的功能可能与AtALC不同,油茶蒴果的开裂机制可能与拟南芥不同;CoSPT1和CoSPT2的序列相似度只有54.57％,并且与CacuaSPT在同一个亚支,CoSPT1和CoSPT2可能是72.9～101.4百万年前Ad-β全基因组复制的产物.