铁观音茶树甘油-3-磷酸酰基转移酶(CsGPAT)基因克隆及萎凋过程中的表达分析

• 作者: 倪子鑫 周子维 孙云 柳镇章 武清杨 毕婉君 郑玉成
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 铁观音 甘油-3-磷酸酰基转移酶 GPAT基因 生物信息学分析 萎凋
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 429-436
• 页数: 8页
• 分类号: S571.1
• 字数: 5859字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2020.04.010

摘要

[目的]以铁观音茶树鲜叶为试验材料,对参与甘油磷脂代谢途径的茶树甘油-3-磷酸酰基转移酶(Glycerol-3-phosphate acyltransferase,CsGPAT)进行克隆、生物信息学分析以及不同萎凋温度的表达量分析,了解GPAT基因在茶叶萎凋过程中的重要意义,以期为茶叶萎凋过程中温度调控提供理论基础.[方法]基于乌龙茶加工(萎凋)转录组数据,筛选获得茶树GPAT同源序列.利用ExPASy Protparam、SMART、SignalP 4.1Server、PSORT、prediction protein等在线软件进行生物信息学分析,利用SWISS-MODEL在线工具编辑GPAT蛋白质三维结构;在NCBI Blastp进行氨基酸序列同源比对.提取铁观音叶片RNA进行qRT-PCR,检测实时表达情况,克隆茶树GPAT基因全长.[结果]克隆得出CsGPAT(IDcsa:CSA000941.1/IDcss:TEA019813.1)基因序列全长1554 bp,编码497个氨基酸;GPAT蛋白属于稳定疏水性蛋白,不含信号肽,具有磷脂生物合成功能的PlsC域;进化树分析表明CsGPAT基因与油茶的亲缘关系最近.qRT-PCR分析结果显示CsGPAT基因在20℃ 温度萎凋时表达量最高.[结论]CsGPAT基因在茶叶萎凋受到相对低温胁迫时,表达量上调,表明CsGPAT表达与茶叶萎凋过程中的温度调控密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙云	福建农林大学园艺学院	82	1026	18.0	29.0
2	周子维	福建农林大学园艺学院	17	77	4.0	8.0
3	毕婉君	福建农林大学园艺学院	2	2	1.0	1.0
4	武清杨	福建农林大学园艺学院	1	0	0.0	0.0
5	郑玉成	福建农林大学园艺学院	2	1	1.0	1.0
6	倪子鑫	福建农林大学园艺学院	2	3	1.0	1.0
7	柳镇章	福建农林大学园艺学院	1	0	0.0	0.0