蚕豆萎蔫病毒2号辽宁藜分离物的鉴定

• 作者: 于美春 侯秋实 李梁 杨彩霞 王筠竹
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: Fabavirus 蚕豆萎蔫病毒2号 藜 分子特征
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 446-453
• 页数: 8页
• 分类号: S432.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1700.2020.04.009

摘要

2016年6月在辽宁省沈阳市采集到表现为疑似蚕豆萎蔫病毒2号所致皱缩症状的藜病叶样品.选取明显病症样品送华大基因进行RNA提取和质量检测,得到OD260/280为2.09,OD260/230为1.85,RIN值为7以及28S/18S为1.3的合格样品.利用该RNA样品构建了去除rRNA的转录组库,经BGISEQ-500平台测序得到11.83 Gb数据.数据经过CLC Genomics Workbench(CLC bio v10.0,Aarhus,Denmark)软件过滤和拼接后获得长度为5945和3550的2个contigs,其经BLASTn和BLASTx比对显示与BBWV2的高度同源.基于此contigs序列,设计7对引物对病毒样品进行RT-PCR扩增,得到5891个核苷酸的RNA1序列(GenBank登录号为MN786954),3549个核苷酸的RNA2序列(GenBank登录号为MN786955).基于该病毒cp基因的氨基酸序列进行同源性分析,发现该病毒与韩国益母草分离物BBWV2-[SK:Leonurus sibiricus](KM076649)同源性最高,为96.5％.根据Fabavirus的分类标准,认为该病毒是BBWV2的辽宁分离物.这是国际上首次报道藜科植物感染BBWV2.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨彩霞		7	10	2.0	2.0
2	王筠竹		3	0	0.0	0.0
3	李梁		1	0	0.0	0.0
4	侯秋实		1	0	0.0	0.0
5	于美春		1	0	0.0	0.0