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桃MRLK家族全基因组鉴定及蚜虫侵染后的表达分析
桃MRLK家族全基因组鉴定及蚜虫侵染后的表达分析
作者:
孟君仁
崔国朝
曾文芳
樊美丽
潘磊
牛良
王志强
靳哲
鲁振华
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
桃
MRLK类受体激酶
生物信息学分析
桃绿蚜
基因表达
摘要:
以Malectin (PF11721)、Malectin-like (PF 12819)和Pkinase (PF07714)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定桃(Prunus persica)基因组中全部MRLK类受体激酶(Malectin receptor-like kinases)家族成员,并利用转录组测序分析桃绿蚜侵染不同时间MRLK在抗蚜和感蚜品系材料中的表达情况.利用生物信息学手段进行分析,共获得41个MRLK家族成员,这些基因分布在桃的8条染色体上.家族成员氨基酸数量介于391~1 035 aa,分子量44.05~115.09kD,等电点5.38~9.16.分析系统进化树发现拟南芥、水稻和桃的MRLK家族分为5个亚组,其中桃MRLK家族成员分布在Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ亚组上.亚细胞定位预测显示该家族成员全部定位在细胞膜上.顺式作用元件预测结果显示该家族成员启动子包含光、激素以及响应生物与非生物胁迫的作用元件.桃绿蚜侵染结果表明,桃MRLK家族中19个基因在5个桃材料中均未表达,15个基因在抗蚜品系'P5868'与其他4个材料之间无差异表达.PpMRLK2、PpMRLK9、PpMRLK22、Pp MRLK23、PpMRLK24、PpMRLK26和PpMRLK32在抗蚜品系'P5868'中表达量比其他品系高,其中PpMRLK26表达量差异显著.进一步分析发现,在抗蚜品系'P5868'中表达的22个MRLK呈组成型表达,蚜虫侵染处理不会对基因的表达产生影响.综上,推测PpMRLK26可能调控抗蚜品系'P5868'的抗蚜性状的形成.
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篇名
桃MRLK家族全基因组鉴定及蚜虫侵染后的表达分析
来源期刊
园艺学报
学科
农学
关键词
桃
MRLK类受体激酶
生物信息学分析
桃绿蚜
基因表达
年,卷(期)
2020,(8)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1438-1450
页数
13页
分类号
S662.1
字数
语种
中文
DOI
10.16420/j.issn.0513-353x.2019-0974
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桃
MRLK类受体激酶
生物信息学分析
桃绿蚜
基因表达
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
园艺学报
主办单位:
中国园艺学会
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0513-353X
CN:
11-1924/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
82-471
创刊时间:
1962
语种:
chi
出版文献量(篇)
6617
总下载数(次)
13
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