红松查尔酮合成酶基因CHS密码子偏好性分析

• 作者: 孔令远 孟庆刚 曹森林 李喜鹏 李翔 王井源 王德秋 王淇 范作义 赵曦阳
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 红松 查尔酮合成酶 密码子偏好性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 447-457
• 页数: 11页
• 分类号: S791.247
• 字数: 6837字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2020.03.017

摘要

查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)广泛存在于植物体内,是花色素形成过程中一种重要的酶,可以进一步催化生成黄酮类化合物.本研究采用CodonW和EMBOSS在线软件对红松查尔酮合成酶基因CHS的密码子使用偏好性进行分析,并与北美乔松等其他24种植物的CHS基因以及模式植物基因组进行比较,对认识红松CHS基因的密码子使用偏好性,为选择适宜的表达系统奠定了一定的基础.研究结果表明:红松CHS基因编码区的有效密码子数(ENC)和GC含量分别为48.92和0.548,C+G含量高于A+T含量,密码子偏好以A/T结尾;多数植物CHS基因的G+C含量高于A+T含量,且密码子更偏好C/G结尾;聚类分析表明,红松与马尾松和赤松的密码子使用偏好性的相似性较高;密码子使用频率研究发现,红松CHS遗传转化与异源表达较优的受体可能是大肠杆菌和拟南芥.