基于番红花转录组的碳氮代谢基因挖掘

• 作者: 周琳 张永春 杨柳燕 王桢 蔡友铭
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 番红花 转录组 碳氮代谢 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 265-274
• 页数: 10页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13592/j.cnki.ppj.2019.0104

摘要

番红花球茎是其开花和新球茎形成的基础,促进番红花种球中营养物质积累、提高番红花繁殖效率是解决国内番红花产量供不应求的有效途径,而番红花种球生长和繁殖与生长发育期间碳氮代谢途径密切相关,深入研究番红花生长发育机理,尤其是碳氮代谢途径是番红花栽培和繁育体系优化的前提.通过对番红花已有转录组数据进行从头组装,得到62 105条unigene序列.注释结果表明,仅有55.89％序列能够注释到公共数据库,注释到GO分类和KEGG注释的unigene分别为36 661和14 185条.通过生物信息学分析,挖掘番红花多个参与碳氮代谢的重要基因和转录因子,包含了蔗糖合成酶基因、蔗糖磷酸合成酶基因、磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因、谷氨酸合成酶基因和碳酸酐酶基因等,以及转录因子GATA和DOF.研究结果可为番红花生长发育功能基因的发掘与利用研究提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张永春		46	408	11.0	19.0
2	杨柳燕		31	42	4.0	5.0
3	蔡友铭		16	11	2.0	3.0
4	周琳		9	11	1.0	3.0
5	王桢		6	0	0.0	0.0